Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pfdn6Q03958 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pfdn6Q03958 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms