Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VldlrP98156 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VldlrP98156 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VldlrP98156 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
VldlrP98156 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VldlrP98156 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.6 ms