Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmklr1P97468 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cmklr1P97468 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms