Protein–RNA interactions for Protein: P43137

Reg1, Lithostathine-1, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reg1P43137 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Reg1P43137 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Reg1P43137 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reg1P43137 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Reg1P43137 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Reg1P43137 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Reg1P43137 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Reg1P43137 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Reg1P43137 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Reg1P43137 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Reg1P43137 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Reg1P43137 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reg1P43137 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Reg1P43137 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reg1P43137 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Reg1P43137 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reg1P43137 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reg1P43137 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Reg1P43137 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reg1P43137 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reg1P43137 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Reg1P43137 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reg1P43137 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reg1P43137 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reg1P43137 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reg1P43137 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reg1P43137 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Reg1P43137 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reg1P43137 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reg1P43137 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Reg1P43137 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reg1P43137 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reg1P43137 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Reg1P43137 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reg1P43137 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Reg1P43137 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Reg1P43137 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Reg1P43137 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reg1P43137 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Reg1P43137 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reg1P43137 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reg1P43137 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reg1P43137 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Reg1P43137 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Reg1P43137 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms