Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TfamP40630 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TfamP40630 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TfamP40630 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TfamP40630 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TfamP40630 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TfamP40630 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TfamP40630 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TfamP40630 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TfamP40630 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TfamP40630 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TfamP40630 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TfamP40630 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TfamP40630 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TfamP40630 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TfamP40630 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TfamP40630 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TfamP40630 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TfamP40630 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TfamP40630 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TfamP40630 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TfamP40630 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TfamP40630 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TfamP40630 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TfamP40630 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TfamP40630 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TfamP40630 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TfamP40630 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TfamP40630 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TfamP40630 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TfamP40630 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TfamP40630 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TfamP40630 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TfamP40630 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TfamP40630 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TfamP40630 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TfamP40630 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TfamP40630 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TfamP40630 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TfamP40630 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TfamP40630 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TfamP40630 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TfamP40630 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TfamP40630 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TfamP40630 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TfamP40630 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TfamP40630 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TfamP40630 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TfamP40630 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TfamP40630 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TfamP40630 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TfamP40630 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TfamP40630 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TfamP40630 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TfamP40630 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TfamP40630 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TfamP40630 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TfamP40630 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TfamP40630 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TfamP40630 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TfamP40630 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TfamP40630 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TfamP40630 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TfamP40630 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TfamP40630 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TfamP40630 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TfamP40630 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TfamP40630 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TfamP40630 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TfamP40630 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TfamP40630 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TfamP40630 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TfamP40630 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TfamP40630 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TfamP40630 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TfamP40630 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TfamP40630 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TfamP40630 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TfamP40630 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TfamP40630 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TfamP40630 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TfamP40630 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TfamP40630 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TfamP40630 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TfamP40630 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TfamP40630 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TfamP40630 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TfamP40630 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TfamP40630 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TfamP40630 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TfamP40630 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TfamP40630 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TfamP40630 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TfamP40630 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TfamP40630 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TfamP40630 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TfamP40630 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TfamP40630 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TfamP40630 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TfamP40630 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.3 ms