Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxa10P31310 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms