Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tacr1P30548 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms