Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cnga1P29974 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms