Protein–RNA interactions for Protein: O88554

Parp2, Poly [ADP-ribose] polymerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp2O88554 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Parp2O88554 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Parp2O88554 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Parp2O88554 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Parp2O88554 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Parp2O88554 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Parp2O88554 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Parp2O88554 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Parp2O88554 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Parp2O88554 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Parp2O88554 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Parp2O88554 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Parp2O88554 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Parp2O88554 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Parp2O88554 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Parp2O88554 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Parp2O88554 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Parp2O88554 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Parp2O88554 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Parp2O88554 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Parp2O88554 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Parp2O88554 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Parp2O88554 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Parp2O88554 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Parp2O88554 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Parp2O88554 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Parp2O88554 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Parp2O88554 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Parp2O88554 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Parp2O88554 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Parp2O88554 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Parp2O88554 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Parp2O88554 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Parp2O88554 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Parp2O88554 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Parp2O88554 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Parp2O88554 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Parp2O88554 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Parp2O88554 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Parp2O88554 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Parp2O88554 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Parp2O88554 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Parp2O88554 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Parp2O88554 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Parp2O88554 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Parp2O88554 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Parp2O88554 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Parp2O88554 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Parp2O88554 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Parp2O88554 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Parp2O88554 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Parp2O88554 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Parp2O88554 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Parp2O88554 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Parp2O88554 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Parp2O88554 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Parp2O88554 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Parp2O88554 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Parp2O88554 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Parp2O88554 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Parp2O88554 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Parp2O88554 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Parp2O88554 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Parp2O88554 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Parp2O88554 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Parp2O88554 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Parp2O88554 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Parp2O88554 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Parp2O88554 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Parp2O88554 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.3 ms