Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BckdkO55028 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BckdkO55028 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BckdkO55028 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BckdkO55028 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BckdkO55028 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BckdkO55028 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BckdkO55028 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BckdkO55028 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BckdkO55028 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BckdkO55028 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BckdkO55028 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BckdkO55028 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BckdkO55028 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 224 ms