Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdc27A2A6Q5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdc27A2A6Q5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Cdc27A2A6Q5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cdc27A2A6Q5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms