Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trpv2Q9WTR1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trpv2Q9WTR1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Trpv2Q9WTR1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Trpv2Q9WTR1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Trpv2Q9WTR1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Trpv2Q9WTR1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trpv2Q9WTR1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trpv2Q9WTR1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trpv2Q9WTR1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trpv2Q9WTR1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trpv2Q9WTR1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trpv2Q9WTR1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trpv2Q9WTR1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trpv2Q9WTR1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trpv2Q9WTR1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Trpv2Q9WTR1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trpv2Q9WTR1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trpv2Q9WTR1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms