Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Six6Q9QZ28 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms