Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl28Q9JIL2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl28Q9JIL2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms