Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlr1Q9EPQ1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms