Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3J9

Uncharacterized protein CXorf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D3J9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9D3J9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9D3J9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9D3J9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9D3J9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9D3J9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9D3J9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9D3J9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9D3J9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D3J9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D3J9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D3J9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D3J9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D3J9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D3J9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D3J9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D3J9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D3J9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D3J9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D3J9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D3J9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D3J9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms