Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y6

Fbxo25, F-box only protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo25Q9D2Y6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo25Q9D2Y6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo25Q9D2Y6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fbxo25Q9D2Y6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fbxo25Q9D2Y6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fbxo25Q9D2Y6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo25Q9D2Y6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms