Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tspan11Q9D1D1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tspan11Q9D1D1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms