Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR59

Gadd45gip1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45gip1Q9CR59 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gadd45gip1Q9CR59 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gadd45gip1Q9CR59 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gadd45gip1Q9CR59 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gadd45gip1Q9CR59 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gadd45gip1Q9CR59 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gadd45gip1Q9CR59 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gadd45gip1Q9CR59 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gadd45gip1Q9CR59 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gadd45gip1Q9CR59 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gadd45gip1Q9CR59 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gadd45gip1Q9CR59 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gadd45gip1Q9CR59 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gadd45gip1Q9CR59 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gadd45gip1Q9CR59 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gadd45gip1Q9CR59 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gadd45gip1Q9CR59 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Gadd45gip1Q9CR59 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gadd45gip1Q9CR59 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gadd45gip1Q9CR59 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gadd45gip1Q9CR59 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gadd45gip1Q9CR59 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gadd45gip1Q9CR59 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gadd45gip1Q9CR59 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gadd45gip1Q9CR59 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gadd45gip1Q9CR59 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms