Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mid1ip1Q9CQ20 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mid1ip1Q9CQ20 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mid1ip1Q9CQ20 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mid1ip1Q9CQ20 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mid1ip1Q9CQ20 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mid1ip1Q9CQ20 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mid1ip1Q9CQ20 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mid1ip1Q9CQ20 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mid1ip1Q9CQ20 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mid1ip1Q9CQ20 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mid1ip1Q9CQ20 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mid1ip1Q9CQ20 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mid1ip1Q9CQ20 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mid1ip1Q9CQ20 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mid1ip1Q9CQ20 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mid1ip1Q9CQ20 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid1ip1Q9CQ20 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid1ip1Q9CQ20 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid1ip1Q9CQ20 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid1ip1Q9CQ20 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid1ip1Q9CQ20 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid1ip1Q9CQ20 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid1ip1Q9CQ20 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid1ip1Q9CQ20 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid1ip1Q9CQ20 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid1ip1Q9CQ20 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid1ip1Q9CQ20 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid1ip1Q9CQ20 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid1ip1Q9CQ20 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid1ip1Q9CQ20 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid1ip1Q9CQ20 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mid1ip1Q9CQ20 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms