Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gps1Q99LD4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gps1Q99LD4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms