Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q0

Commd9, COMM domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd9Q8K2Q0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Commd9Q8K2Q0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Commd9Q8K2Q0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Commd9Q8K2Q0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Commd9Q8K2Q0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Commd9Q8K2Q0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Commd9Q8K2Q0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Commd9Q8K2Q0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Commd9Q8K2Q0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Commd9Q8K2Q0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Commd9Q8K2Q0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Commd9Q8K2Q0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Commd9Q8K2Q0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms