Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atad2Q8CDM1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atad2Q8CDM1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms