Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms