Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Grik4Q8BMF5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grik4Q8BMF5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms