Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJX2

6820408C15Rik, RIKEN cDNA 6820408C15, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6820408C15RikQ8BJX2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
6820408C15RikQ8BJX2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
6820408C15RikQ8BJX2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
6820408C15RikQ8BJX2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
6820408C15RikQ8BJX2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
6820408C15RikQ8BJX2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
6820408C15RikQ8BJX2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
6820408C15RikQ8BJX2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
6820408C15RikQ8BJX2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
6820408C15RikQ8BJX2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
6820408C15RikQ8BJX2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
6820408C15RikQ8BJX2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
6820408C15RikQ8BJX2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
6820408C15RikQ8BJX2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
6820408C15RikQ8BJX2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
6820408C15RikQ8BJX2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
6820408C15RikQ8BJX2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
6820408C15RikQ8BJX2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
6820408C15RikQ8BJX2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
6820408C15RikQ8BJX2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
6820408C15RikQ8BJX2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
6820408C15RikQ8BJX2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
6820408C15RikQ8BJX2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
6820408C15RikQ8BJX2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
6820408C15RikQ8BJX2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
6820408C15RikQ8BJX2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
6820408C15RikQ8BJX2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
6820408C15RikQ8BJX2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
6820408C15RikQ8BJX2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
6820408C15RikQ8BJX2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms