Protein–RNA interactions for Protein: Q80U93

Nup214, Nuclear pore complex protein Nup214, mousemouse

Predictions only

Length 2,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup214Q80U93 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup214Q80U93 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup214Q80U93 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms