Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptx4Q6RUU0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptx4Q6RUU0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms