Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Foxd1Q61345 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Foxd1Q61345 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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