Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ctf1Q60753 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctf1Q60753 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms