Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nkain3Q3URJ8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkain3Q3URJ8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkain3Q3URJ8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkain3Q3URJ8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkain3Q3URJ8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkain3Q3URJ8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkain3Q3URJ8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkain3Q3URJ8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkain3Q3URJ8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms