Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lmod2Q3UHZ5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lmod2Q3UHZ5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lmod2Q3UHZ5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lmod2Q3UHZ5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lmod2Q3UHZ5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lmod2Q3UHZ5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lmod2Q3UHZ5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lmod2Q3UHZ5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lmod2Q3UHZ5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lmod2Q3UHZ5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms