Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Nkx6-3Q3UHX8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
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Nkx6-3Q3UHX8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Nkx6-3Q3UHX8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Nkx6-3Q3UHX8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms