Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ulk3Q3U3Q1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms