Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Trappc10Q3TLI0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trappc10Q3TLI0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc10Q3TLI0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc10Q3TLI0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc10Q3TLI0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc10Q3TLI0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc10Q3TLI0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc10Q3TLI0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc10Q3TLI0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc10Q3TLI0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc10Q3TLI0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc10Q3TLI0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc10Q3TLI0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc10Q3TLI0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc10Q3TLI0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc10Q3TLI0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc10Q3TLI0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc10Q3TLI0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc10Q3TLI0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc10Q3TLI0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc10Q3TLI0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc10Q3TLI0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc10Q3TLI0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc10Q3TLI0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc10Q3TLI0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc10Q3TLI0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc10Q3TLI0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc10Q3TLI0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc10Q3TLI0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc10Q3TLI0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc10Q3TLI0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc10Q3TLI0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms