Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sdr16c6Q05A13 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sdr16c6Q05A13 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sdr16c6Q05A13 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Sdr16c6Q05A13 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sdr16c6Q05A13 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sdr16c6Q05A13 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sdr16c6Q05A13 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sdr16c6Q05A13 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sdr16c6Q05A13 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sdr16c6Q05A13 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sdr16c6Q05A13 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sdr16c6Q05A13 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sdr16c6Q05A13 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sdr16c6Q05A13 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sdr16c6Q05A13 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sdr16c6Q05A13 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sdr16c6Q05A13 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sdr16c6Q05A13 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms