Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
rp9P97762 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
rp9P97762 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
rp9P97762 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
rp9P97762 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
rp9P97762 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
rp9P97762 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
rp9P97762 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
rp9P97762 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
rp9P97762 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
rp9P97762 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
rp9P97762 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
rp9P97762 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
rp9P97762 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
rp9P97762 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
rp9P97762 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
rp9P97762 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
rp9P97762 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
rp9P97762 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
rp9P97762 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
rp9P97762 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
rp9P97762 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
rp9P97762 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
rp9P97762 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
rp9P97762 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
rp9P97762 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
rp9P97762 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
rp9P97762 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
rp9P97762 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
rp9P97762 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
rp9P97762 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
rp9P97762 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
rp9P97762 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
rp9P97762 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
rp9P97762 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
rp9P97762 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
rp9P97762 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
rp9P97762 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
rp9P97762 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
rp9P97762 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
rp9P97762 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
rp9P97762 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
rp9P97762 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
rp9P97762 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
rp9P97762 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
rp9P97762 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
rp9P97762 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
rp9P97762 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
rp9P97762 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
rp9P97762 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
rp9P97762 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
rp9P97762 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
rp9P97762 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
rp9P97762 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
rp9P97762 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
rp9P97762 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
rp9P97762 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
rp9P97762 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
rp9P97762 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
rp9P97762 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
rp9P97762 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
rp9P97762 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
rp9P97762 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
rp9P97762 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
rp9P97762 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
rp9P97762 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
rp9P97762 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
rp9P97762 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
rp9P97762 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
rp9P97762 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
rp9P97762 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
rp9P97762 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
rp9P97762 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
rp9P97762 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
rp9P97762 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
rp9P97762 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
rp9P97762 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
rp9P97762 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
rp9P97762 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
rp9P97762 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
rp9P97762 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
rp9P97762 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
rp9P97762 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
rp9P97762 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
rp9P97762 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
rp9P97762 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
rp9P97762 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
rp9P97762 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
rp9P97762 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
rp9P97762 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
rp9P97762 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
rp9P97762 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
rp9P97762 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
rp9P97762 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
rp9P97762 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
rp9P97762 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
rp9P97762 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
rp9P97762 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
rp9P97762 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
rp9P97762 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms