Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RptnP97347 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RptnP97347 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RptnP97347 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RptnP97347 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RptnP97347 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RptnP97347 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RptnP97347 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RptnP97347 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RptnP97347 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RptnP97347 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RptnP97347 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RptnP97347 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RptnP97347 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RptnP97347 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RptnP97347 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RptnP97347 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RptnP97347 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RptnP97347 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RptnP97347 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RptnP97347 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RptnP97347 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RptnP97347 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RptnP97347 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RptnP97347 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RptnP97347 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RptnP97347 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RptnP97347 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RptnP97347 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RptnP97347 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RptnP97347 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RptnP97347 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RptnP97347 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RptnP97347 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RptnP97347 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RptnP97347 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RptnP97347 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RptnP97347 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RptnP97347 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RptnP97347 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RptnP97347 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RptnP97347 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RptnP97347 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RptnP97347 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RptnP97347 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RptnP97347 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RptnP97347 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RptnP97347 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RptnP97347 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RptnP97347 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RptnP97347 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RptnP97347 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RptnP97347 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RptnP97347 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RptnP97347 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RptnP97347 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RptnP97347 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RptnP97347 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RptnP97347 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RptnP97347 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RptnP97347 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RptnP97347 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RptnP97347 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RptnP97347 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RptnP97347 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RptnP97347 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RptnP97347 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RptnP97347 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RptnP97347 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RptnP97347 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RptnP97347 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RptnP97347 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RptnP97347 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RptnP97347 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RptnP97347 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RptnP97347 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RptnP97347 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RptnP97347 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RptnP97347 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RptnP97347 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RptnP97347 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RptnP97347 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RptnP97347 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RptnP97347 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RptnP97347 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RptnP97347 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RptnP97347 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RptnP97347 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RptnP97347 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RptnP97347 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RptnP97347 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RptnP97347 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RptnP97347 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RptnP97347 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RptnP97347 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RptnP97347 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RptnP97347 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RptnP97347 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RptnP97347 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RptnP97347 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms