Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox2P48432 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox2P48432 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox2P48432 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sox2P48432 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sox2P48432 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sox2P48432 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox2P48432 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox2P48432 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox2P48432 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox2P48432 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox2P48432 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox2P48432 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox2P48432 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox2P48432 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox2P48432 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox2P48432 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox2P48432 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox2P48432 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox2P48432 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox2P48432 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox2P48432 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox2P48432 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox2P48432 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox2P48432 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox2P48432 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox2P48432 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox2P48432 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox2P48432 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox2P48432 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox2P48432 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox2P48432 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox2P48432 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox2P48432 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox2P48432 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox2P48432 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox2P48432 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox2P48432 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox2P48432 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox2P48432 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox2P48432 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox2P48432 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox2P48432 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox2P48432 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms