Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Cnga1P29974 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cnga1P29974 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cnga1P29974 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms