Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb9P28076 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms