Protein–RNA interactions for Protein: P01725

Ig lambda-1 chain V region S178, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01725 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01725 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01725 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01725 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01725 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01725 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01725 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01725 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01725 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01725 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01725 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01725 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01725 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01725 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01725 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01725 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01725 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01725 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01725 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01725 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01725 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01725 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01725 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01725 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01725 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01725 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01725 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01725 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01725 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01725 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01725 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01725 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01725 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01725 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01725 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01725 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01725 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01725 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01725 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01725 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01725 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01725 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01725 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01725 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01725 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01725 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01725 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01725 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01725 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01725 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01725 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01725 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01725 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01725 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01725 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01725 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01725 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01725 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01725 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01725 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01725 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01725 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01725 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01725 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01725 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01725 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01725 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01725 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01725 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01725 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01725 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01725 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01725 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01725 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01725 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01725 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01725 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01725 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01725 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01725 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01725 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01725 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01725 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01725 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01725 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01725 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01725 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01725 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01725 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01725 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01725 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01725 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01725 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01725 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01725 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01725 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01725 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01725 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01725 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01725 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms