Protein–RNA interactions for Protein: O88554

Parp2, Poly [ADP-ribose] polymerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp2O88554 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Parp2O88554 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Parp2O88554 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Parp2O88554 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Parp2O88554 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Parp2O88554 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Parp2O88554 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Parp2O88554 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Parp2O88554 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Parp2O88554 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Parp2O88554 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms