Protein–RNA interactions for Protein: O88343

Slc4a4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a4O88343 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc4a4O88343 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc4a4O88343 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc4a4O88343 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms