Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2f6O54917 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
E2f6O54917 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2f6O54917 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2f6O54917 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2f6O54917 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2f6O54917 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2f6O54917 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
E2f6O54917 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2f6O54917 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
E2f6O54917 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
E2f6O54917 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
E2f6O54917 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
E2f6O54917 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
E2f6O54917 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2f6O54917 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2f6O54917 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2f6O54917 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2f6O54917 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2f6O54917 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2f6O54917 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2f6O54917 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
E2f6O54917 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2f6O54917 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2f6O54917 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2f6O54917 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2f6O54917 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2f6O54917 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2f6O54917 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
E2f6O54917 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2f6O54917 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2f6O54917 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2f6O54917 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2f6O54917 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2f6O54917 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms