Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gp1baO35930 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gp1baO35930 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gp1baO35930 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gp1baO35930 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gp1baO35930 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gp1baO35930 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gp1baO35930 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gp1baO35930 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gp1baO35930 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gp1baO35930 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gp1baO35930 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gp1baO35930 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gp1baO35930 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gp1baO35930 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gp1baO35930 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gp1baO35930 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gp1baO35930 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gp1baO35930 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gp1baO35930 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gp1baO35930 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gp1baO35930 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gp1baO35930 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gp1baO35930 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gp1baO35930 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gp1baO35930 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms