Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnf5O35445 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnf5O35445 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf5O35445 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rnf5O35445 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf5O35445 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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