Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Srsf5O35326 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Srsf5O35326 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srsf5O35326 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srsf5O35326 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.4 ms