Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mfsd4b4J3QNS5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mfsd4b4J3QNS5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms