Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem200cJ3QK46 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms